Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06323 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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