Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms