Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Foxq1O70220 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms