Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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