Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DffaO54786 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DffaO54786 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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