Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FxnO35943 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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FxnO35943 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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FxnO35943 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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FxnO35943 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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FxnO35943 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FxnO35943 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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FxnO35943 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
FxnO35943 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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