Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smad6O35182 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smad6O35182 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smad6O35182 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smad6O35182 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smad6O35182 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smad6O35182 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smad6O35182 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smad6O35182 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smad6O35182 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smad6O35182 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smad6O35182 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smad6O35182 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smad6O35182 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smad6O35182 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms