Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms