Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms