Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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