Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm379J3QQ19 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms