Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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