Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lipo1J3QME6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms