Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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