Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf148G3X9R7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf148G3X9R7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf148G3X9R7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf148G3X9R7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf148G3X9R7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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