Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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