Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rnf212F6TQD1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms