Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Defa35E9QLQ1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Defa35E9QLQ1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Defa35E9QLQ1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Defa35E9QLQ1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Defa35E9QLQ1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Defa35E9QLQ1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Defa35E9QLQ1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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Defa35E9QLQ1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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Defa35E9QLQ1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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Defa35E9QLQ1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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