Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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