Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3298E9PW80 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3298E9PW80 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms