Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc175E9PVB3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms