Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms