Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms