Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3543D3Z235 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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