Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap70D3YVL2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap70D3YVL2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms