Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17333C6EQI3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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