Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Phf11bB4XVQ1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Phf11bB4XVQ1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Phf11bB4XVQ1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms