Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms