Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms