Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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