Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ambra1A2AH22 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ambra1A2AH22 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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