Protein–RNA interactions for Protein: A2AED3

Fndc7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc7A2AED3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fndc7A2AED3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms