Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms