Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms