Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ilf3Q9Z1X4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms