Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Lgr5Q9Z1P4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Lgr5Q9Z1P4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Lgr5Q9Z1P4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Lgr5Q9Z1P4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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