Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms