Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Pfdn5Q9WU28 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pfdn5Q9WU28 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pfdn5Q9WU28 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pfdn5Q9WU28 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pfdn5Q9WU28 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pfdn5Q9WU28 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pfdn5Q9WU28 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pfdn5Q9WU28 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Pfdn5Q9WU28 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pfdn5Q9WU28 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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