Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbnQ9R207 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms