Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmed2Q9R0Q3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms