Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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