Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms