Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rdh11Q9QYF1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rdh11Q9QYF1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rdh11Q9QYF1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rdh11Q9QYF1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rdh11Q9QYF1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rdh11Q9QYF1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Rdh11Q9QYF1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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