Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Tomm40Q9QYA2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms