Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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