Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms