Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl39Q9JKF7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms