Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms