Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Rb1cc1Q9ESK9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
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Rb1cc1Q9ESK9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Rb1cc1Q9ESK9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Rb1cc1Q9ESK9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Rb1cc1Q9ESK9 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Rb1cc1Q9ESK9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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