Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SelenofQ9ERR7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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